故事开端为第一季故事的七年之后。　　高达模型对战的规则被革新，亦令其对战更受欢迎。　　虽然伊织诚和岭司得到第7回敢达模型对战世界大赛的冠军，也令学校圣凤学园沾光不少。不过，其“高达模型对战部”就只剩下部长—国中部3年级学生·星野文奈一人。　　在新比赛规则底下，如果要参加比赛必须以3人1组的参与战斗。

新学期刚开始，高中生·坂井悠二一如往常过着“日常生活”。然而有一天，他冷不防遭遇红世之王手下的侵袭。受到一名能够把人的存在化为灵火，并吸取灵火的神秘男子法利亚格尼的攻击。悠二的“日常”生活因此整个脱节，然而就在同一时间，一名少女出现在他面前。　　少女为了保护悠二不被法利亚格尼袭击，开始与悠二一同生活

新世纪之初不久某年的夏天，为了与父亲生活，逢泽步来到了距东京2小时火车车程的小镇。　　步是不去上学的中学生。原因不明。似乎和什么样的理由都沾一点边，但又不是那种理由。觉得无论走到哪、无论做什么都无聊的步，来和父亲度过一个夏天，是因为母亲出的主意。双亲在他还小的时候离婚了，他和父亲也4年没有见面了。步

战国时代──以恐怖来统治天下最凶最恶的武将“牙鬼幻月”。由“伊贺崎家”率领的一群忍者，经过激烈的战斗，打倒了“牙鬼幻月”。 但“牙鬼幻月”却留下了不详的预言… “444年后，我将变成妖怪复活再次以恐怖支配天下！”时光流逝—— 终结忍者“伊贺崎好天”跟复活的妖怪“牙鬼幻月”决斗，并成功将它封印。时光再

天使惠（林原惠美 配音）本是铮铮男儿，可六岁那一年，在阴差阳错之下，他打开了一本魔法书，并被书中的恶魔变成了女孩，不仅如此，恶魔还消除了所有认识天使惠的人的记忆，这样即便天使惠喊破喉咙，也没有人相信他的男儿身。　　就这样，顶着一副所有女人都会心生羡慕的美丽面庞的天使惠渐渐长大，并且升入了高中，学校里

　　战国时代──以恐怖来统治天下最凶最恶的武将“牙鬼幻月”。由“伊贺崎家”率领的一群忍者，经过激烈的战斗，打倒了“牙鬼幻月”。但“牙鬼幻月”却留下了不详的预言…“444年后，我将变成妖怪复活再次以恐怖支配天下！”时光流逝——终结忍者“伊贺崎好天”跟复活的妖怪“牙鬼幻月”决斗，并成功将它封印。时光再

这个「国家」正隐瞒着什么——自从在“地下”的激战结束后，森罗他们知晓了「传教者」的野心。他们的目的是集合所有「安德拉爆炎」的拥有者，重现贰佰伍拾年前发生的大灾难，毁灭世界。身为安德拉爆炎的拥有者，森罗已被传教者盯上，但他仍在为了阻止传教者的目的而持续行动着。与拥有「安德拉爆炎」的少女相遇，以及，被皇

原島拓也、時村和樹和須賀沼大三名少年机缘巧合地获得了神奇的宝石パワーストーン，并唤醒了勇者机器人ドラン。而ワルザック共和帝国的第一王子ワルター则为了自己的野心而对三人发动了攻击，于是少年们的战斗就这么开始了。

“読む劇薬”と称される鬼才・野﨑まど氏による小説『バビロン』。野﨑氏の代表作である本作のアニメ化が決定し、作品をイメージした荘厳な教会に居座る謎の女のビジュアル（イラスト：原作カバー担当・ざいん）と、...

影片由《灌篮高手》原作者井上雄彦编剧和执导，同时是该系列第五部剧场动画，并启用全新声优阵容。以宫城良田为主线，讲述全国大赛湘北高中VS山王工业一战。